تشترك الكائنات الحية في تكونها من عناصر مجهرية تسمى الخلايا وهذه الخلايا حيوانية كانت أو نباتية لها نفس النظام فهي تتكون من السيتوبلازما يحيطها غشاء مخاطي وفي وسطها نواة. ويمكننا أن نكتشف بواسطة الميكروسكوب خلايا البصلة وهي مرتبطة ومرصوفة مثل القرميد
في الحائط. أمّا بالنسبة إلى الطماطم فلنكتشف بواسطة مجهر المادّة الّتي تمنحها لونها الأحمر. نقطع حبّة الطّماطم إلى نصفين ونسحب بحذر بعض العصير من الجزء المحاذي للبذور بواسطة السكّين، ثمّ نضع العيّنة فوق صفيحة ونغطّيها برقاقة مجهريّة ونضغط عليها برفق حتّى تتمدّد عيّنة الطّماطم كليّا. نلاحظ ظهور عدد كبير من الخلايا التي تحتوي نواة صغيرة وبلّورات مادة حمراء تسمّى صباغا.